《康熙微服私访记3》的故事继续围绕康熙皇帝微服出巡的冒险展开。这一集中，康熙（张国立饰）带着三德子、法印和小桃红来到一个小镇，发现当地百姓生活困苦，而官府却横征暴敛，百姓怨声载道。康熙决定深入调查，揭开这背后的黑幕。

  一行人扮作普通商贩住进了一家客栈。夜里，康熙听到隔壁房间有人低声哭泣，便让三德子去打探。原来是一位老农因交不起苛捐杂税，被官府抓走了儿子，老农走投无路，只能偷偷哭泣。康熙听后心生怜悯，决定第二天去县衙一探究竟。

  次日，康熙带着三德子来到县衙，发现县官正与当地富商勾结，借征收税款之名中饱私囊。百姓稍有反抗，就会被抓进大牢。康熙假意献上一件“宝物”，想借此接近县官。县官见钱眼开，对康熙的态度立刻热情起来，还邀请他参加晚上的宴会。

  宴会上，县官和富商们大肆挥霍，酒肉满桌，而百姓却连饭都吃不上。康熙越看越气，但为了收集证据，他强压怒火，与县官周旋。席间，他故意提起老农的儿子，县官得意洋洋地说：“这些刁民不交税，就得吃点苦头！”康熙暗暗记下这些话，准备日后清算。

  回到客栈后，康熙与三德子等人商量对策。他们决定夜里潜入县衙大牢，救出被关押的百姓。法印身手敏捷，轻松放倒了守卫，一行人顺利进入大牢。见到老农的儿子和其他无辜百姓后，康熙亮明身份，众人又惊又喜，纷纷跪地谢恩。

  第二天，康熙以真实身份来到县衙，县官吓得魂飞魄散，跪地求饶。康熙当众宣布县官的罪行，并下令将他革职查办，同时减免了当地的赋税。百姓们欢呼雀跃，高呼“皇上万岁”。康熙感慨道：“为官一任，造福一方，若只知盘剥百姓，与强盗何异？”

  故事的最后，康熙一行人离开小镇，继续他们的微服私访之旅。这一集的剧情既展现了康熙的智慧与仁慈，也揭露了贪官污吏的丑恶嘴脸，让观众在跌宕起伏的情节中感受到正义的力量。