《心动千年》的故事紧接上一集的悬念展开，主角苏婉和秦墨在寻找千年古玉的路上遇到了新的挑战。这一集的开头，两人在山间小路上被一群黑衣人围堵，对方显然是为了古玉而来。苏婉机敏地察觉到危险，拉着秦墨躲进了一片密林。夜色中，两人屏住呼吸，听着黑衣人的脚步声渐渐远去，这才松了一口气。

  然而，危机并未解除。秦墨发现自己的背包在逃跑时被划破，古玉的线索地图不见了。苏婉安慰他不要着急，提议先找个安全的地方休息。两人找到一间废弃的山神庙，生起火堆取暖。火光映照下，秦墨终于说出了藏在心底的秘密——原来他的家族世代守护着这块古玉，而古玉背后隐藏着一个关于长生不老的传说。

  苏婉听后震惊不已，但她并没有责怪秦墨隐瞒真相，反而被他的坦诚打动。两人决定一起解开古玉的秘密。第二天清晨，他们根据记忆重新绘制了地图，继续赶路。途中，苏婉偶然发现了一块刻有奇怪符号的石头，符号与古玉上的纹路极为相似。秦墨仔细研究后，认为这是古人留下的指引，或许能带他们找到古玉的真正所在。

  就在两人兴奋之际，黑衣人再次出现。这次对方人多势众，秦墨为了保护苏婉，主动引开敌人。苏婉心急如焚，却无能为力，只能按照秦墨的嘱咐继续前行。她顺着符号的指引，来到一座古老的祭坛前。祭坛中央摆放着一个石匣，匣中正是那块传说中的千年古玉。

  苏婉刚拿起古玉，黑衣人首领突然现身，冷笑道：“终于找到了。”原来这一切都是他的阴谋，他早就知道苏婉和秦墨会找到这里。危急关头，秦墨赶来与黑衣人展开搏斗。苏婉趁机启动了祭坛的机关，地面突然裂开，黑衣人纷纷跌落。秦墨拉着苏婉逃离险境，两人终于摆脱了追兵。

  回到安全的地方，秦墨告诉苏婉，古玉的力量并非长生不老，而是能让人看到前世的记忆。苏婉半信半疑，但当她触碰古玉的瞬间，脑海中浮现出与秦墨在前世相识的画面。原来两人的缘分早已注定，跨越千年再度相遇。这一集的结尾，苏婉和秦墨相视一笑，决定一起守护古玉的秘密，继续他们的冒险旅程。