《心动千年》的故事，从一场意外的相遇开始。这天，女主角苏婉正在古玩市场闲逛，突然被一块古朴的玉佩吸引。她拿起玉佩仔细端详，指尖触碰的瞬间，眼前闪过陌生又熟悉的画面——仿佛穿越了千年。

  还没等她回过神，身后传来一个低沉的声音：“这块玉佩，不适合你。”苏婉转身，发现说话的是个陌生男子，眉目如画，却带着几分冷峻。她正想反驳，男子却直接付钱买下玉佩，转身离开。苏婉觉得这人莫名其妙，但心里莫名泛起一丝涟漪。

  晚上，苏婉做了一个奇怪的梦。梦里她穿着古代嫁衣，站在红烛摇曳的房间里，对面正是白天那个冷峻男子。他眼神复杂，轻声说：“这一世，我不会再错过你。”苏婉惊醒，心跳如鼓，分不清是梦境还是现实。

  第二天，苏婉在工作的博物馆里，竟再次遇见了那个男子。原来他是新来的文物修复师，名叫沈墨。两人四目相对，沈墨似乎早就预料到会遇见她，嘴角微微上扬。苏婉又惊又疑，总觉得他藏着什么秘密。

  接下来的日子里，沈墨总是有意无意地出现在苏婉身边。他帮她修复破损的古画，带她去吃巷子深处的老字号，甚至在她加班时默默送来一杯热茶。苏婉渐渐被他的细心打动，但每次想问起玉佩和梦境的事，沈墨都会巧妙地岔开话题。

  直到某天，苏婉在整理馆藏时，发现一幅宋代画像，画中的男子竟和沈墨一模一样。她震惊地翻看史料，发现画中人名叫沈砚，是千年前的一位将军，而他的妻子——竟和自己长得一模一样。苏婉终于明白，那些梦境不是幻觉，而是前世的记忆。

  她冲去找沈墨，质问他到底是谁。沈墨沉默良久，终于坦白：他确实是千年前的沈砚，因执念太深，魂魄未散，辗转千年只为寻找转世的她。玉佩是他们当年的定情信物，也是唤醒记忆的钥匙。苏婉听完，既害怕又心疼，眼泪止不住地流下来。

  就在这时，博物馆突然停电，黑暗中有人偷袭沈墨。原来，当年害死他们的仇人同样转世，一直潜伏在暗处。沈墨为保护苏婉受伤，虚弱之际，他紧紧握住她的手说：“这一世，换我来护你周全。”苏婉终于看清自己的心，哭着抱住他：“不管前世今生，我都不会再离开你。”

  危机暂时解除，但更大的阴谋才刚刚浮出水面。两人决定一起面对，解开千年前的恩怨。月光下，沈墨将玉佩重新戴在苏婉脖子上，轻声说：“这一次，我们不会再错过。”苏婉靠在他肩头，仿佛听见了跨越千年的心跳。