《心动千年》的故事，从一场意外的重逢开始。这天，女主角林小夏在古董店里整理货架，突然发现一枚熟悉的玉佩——那是她前世记忆中的信物。她正出神时，男主角陆远舟推门而入，两人四目相对，空气仿佛凝固了。陆远舟的目光落在玉佩上，眉头微皱，似乎也想起了什么。

  原来，这枚玉佩是千年前两人定情之物。林小夏隐约记起前世的片段：她是将军之女，而陆远舟是敌国皇子，两人在战乱中相爱却被迫分离。如今玉佩重现，仿佛冥冥中自有天意。陆远舟犹豫片刻，终于开口：“这玉佩……你从哪里得到的？”林小夏心跳加速，却故作镇定：“客人寄卖的，怎么了？”

  就在两人试探彼此记忆时，店里来了位神秘客人。这人自称姓赵，对玉佩表现出异常兴趣，甚至开出高价。林小夏本能地拒绝，却注意到陆远舟暗中对她摇头示意。等客人走后，陆远舟才低声道：“这人来历不简单，玉佩可能牵涉到千年前的秘密。”原来，当年两人的悲剧背后，还藏着更大的阴谋。

  当晚，林小夏做梦回到前世。她看见自己穿着嫁衣站在城墙下，而陆远舟浑身是血地赶来，却被乱箭射中。惊醒时，她发现枕边湿了一片。与此同时，陆远舟也在查阅古籍，试图拼凑真相。书中记载，那枚玉佩竟是开启时空之门的钥匙，而姓赵的客人很可能是当年幕后黑手的后人。

  第二天，林小夏决定主动出击。她约陆远舟到江边茶馆，直截了当地问：“你是不是也梦到过去了？”陆远舟苦笑点头，两人终于敞开心扉，分享各自记忆中的碎片。正说着，林小夏突然发现茶馆老板在偷听——那人竟是昨天姓赵的手下！陆远舟反应极快，拉起她就跑，背后传来杂乱的脚步声。

  逃亡途中，陆远舟带林小夏躲进一座废弃道观。月光下，他轻抚着墙上的古老壁画，突然激动地说：“你看！这画的就是当年的事！”壁画上赫然是玉佩悬浮空中、光芒四射的场景。林小夏触碰壁画的瞬间，玉佩突然发出微光，两人眼前闪过更多前世画面——原来他们曾尝试用玉佩扭转时空，却因有人破坏而失败。

  就在此时，道观外火把晃动，追兵已至。陆远舟抓起玉佩塞给林小夏：“这次换我保护你。”他推开通往密道的暗门，却突然闷哼一声——暗处射来的弩箭穿透了他的肩膀。林小夏哭着要留下，陆远舟却用带血的手擦掉她的眼泪：“记住，玉佩绝不能落在他们手里……”话音未落，他用力关上暗门，转身迎向追兵。

  林小夏在黑暗的密道中狂奔，手中玉佩越来越烫。当她冲出密道来到悬崖边时，追兵已包抄过来。绝境中，她想起壁画上的场景，举起玉佩对着月光大喊：“如果真有千年缘分，就再帮我们一次！”刹那间光芒大作，等强光散去，悬崖边空无一人——而千年之前的战场上，多了个穿现代衣服的姑娘。